Seorang yang menyebut dirinya ilmuwan gila yang bernama Okabe Rintarou, menyewa sebuah ruangan yang sudah reyot terletak di sebuah bangunan tua di Akihabara, di mana di sana ia akan memuaskan hasratnya hobinya dalam penemuan gadget masa depan bersama anggota labnya yaitu Mayuri Shiina, yang merupakan teman masa kecilnya, dan Hashida Itaru yang seorang hacker mesum yang memiliki nama panggilan “Daru”. Mereka bertiga melalui hari demi hari dengan benda yang aneh yaitu mesin yang mereka juluki “Phone Microwave” yang mampu melakukan sesuatu yang aneh seperti mengubah pisang menjadi tumpukan gel berwarna hijau.
Meskipun menghasilkan fenomena ajaib, fenomena ini tidak menghasilkan sesuatu yang dicari-cari oleh Okabe untuk sebuah terobosan ilmiah, sampai para anggota lab mengalami serangkaian kejadian misterius sebelum Phone Microwave secara tak terduga mampu mengirim email ke masa lalu, dan mengubah aliran sejarah.
Steins Gate membawa Okabe menuju kedalaman teori ilmiah praktis. Memaksa seluruh benang dari masa lalu dan sekarang terpencar, Okabe harus memikul beban yang datang dengan memegang kunci bidang waktu. Steins;Gate
